सुरक्षा एजेंसियों के अधिकारियों के हवाले से रिपोर्ट्स में दावा किया गया है कि आईएसआई ने नशे के आदी लोगों और महिलाओं को खास ट्रेनिंग देकर भारत में घुसपैठ कराई है. ये लोग भारतीय जेलों में बंद आतंकवादियों के लिए संदेशवाहक के तौर पर काम करते हैं. उन्हें भारतीय सुरक्षा एजेंसियों और बलों से बचने के लिए विशेष प्रशिक्षण भी दिया जाता है। अधिकारियों का दावा है कि ऐसे कई संदेशवाहक पकड़े गए हैं, जिनसे पूछताछ से पता चलता है कि घुसपैठ की बड़ी साजिश रची जा रही है. कुछ माइनरों का भी उपयोग किया जा रहा है।
आईएसआई की घुसपैठ की रणनीति नशीले पदार्थों की तस्करी से भी जुड़ी है। इनका मुख्य निशाना राजस्थान, पंजाब और जम्मू कश्मीर में कैद आतंकी माने जाते हैं। राजस्थान के बिजनौर गांव से एक पाकिस्तानी नागरिक को गिरफ्तार किया गया है. वह मानसिक रूप से परेशान होने का नाटक कर रहा था। जब उससे कड़ी पूछताछ की गई तो पता चला कि उसे पाकिस्तान के ड्रग माफिया सरफराज जोहिया और नवाज ने भारत भेजा था और उसे ड्रग तस्करी के साथ-साथ सीमा सुरक्षा बल (बीएसएफ) की तैनाती के बारे में जानकारी जुटाने का काम सौंपा गया था।
एक अन्य घटना में पाकिस्तान के लाहौर का एक युवक मोहम्मद असद बाइक से भारतीय सीमा में पहुंच गया. हालांकि, बीएसएफ ने उसे गिरफ्तार कर लिया. अधिकारियों का मानना है कि असद एक दूत के रूप में काम कर रहे थे और उन्होंने आगे की जांच के लिए उनकी हिरासत की मांग की है। अक्टूबर में, शाहिद इमरान नाम का एक 31 वर्षीय व्यक्ति जम्मू सेक्टर के माध्यम से भारत में प्रवेश किया, यह दावा करते हुए कि वह शादी करने के लिए काली मंदिर जा रहा था।
अधिकारियों का कहना है कि 1990 के दशक के अंत और 2000 के दशक की शुरुआत में, आईएसआई ने गुप्त संदेशवाहक संचालन के लिए भारत और पाकिस्तान के बीच चलने वाली समझौता एक्सप्रेस का भी इस्तेमाल किया था। आईएसआई जम्मू-कश्मीर और पंजाब में मादक पदार्थों की तस्करी और आतंकवादी गतिविधियों को वित्तीय सहायता देने में शामिल थी। जिसके लिए वह जिन लोगों से संपर्क करती थी उन्हें राइड ऑपरेटर कहा जाता है। 2019 में ट्रेन बंद होने के बाद से ISI का ये प्लान भी बदल गया है.